FISH-test för diagnostisering av cancerbehandlingar
Många olika typer av cancer är förknippade med kända genetiska avvikelser. Och genom genetiska talar vi inte bara om ärftlighet. Under en livstid kan celler göra misstag när de delar sig och växer. Mutationer i DNA som är associerade med cancer kan ackumuleras i dessa celler.
Hur fungerar FISH?
FISH är en teknik som använder fluorescerande sonder för att detektera specifika gener eller delar av gener (DNA-sekvenser). Medicinsk centrumlabbpersonal och onkologer använder FISH för att bedöma patienter som kan ha cancer och ibland övervaka en patient som redan har diagnostiserats med cancer och behandlas.FISH kan göras med hjälp av olika typer av prover beroende på platsen och typen av cancer som misstänks: Tumörceller erhållna från perifert blod, från en benmärgsbiopsi eller från en lymfkörtelbiopsi och formalinfixerad paraffininkroppad vävnad (detta hänvisar till ett prov av vävnad som behandlas i labbet och inbäddad i en typ av vax, vilket gör den mer stel, så att den kan skivas i tunna sektioner och monteras för visning under mikroskopet).
Vad betyder bokstäverna?
"H" i FISH avser hybridisering. I molekylär hybridisering används en märkt DNA eller RNA-sekvens som en sond - visualisera en röd Lego-tegel, om du vill. Sonden används för att hitta en motstående Lego-tegel eller DNA-sekvens i ett biologiskt prov.DNA i ditt prov är som högar av Lego-tegelstenar, och de flesta tegelstenar i dessa högar kommer inte att matcha vår röda sond. Och alla dina tegelstenar är ordentligt organiserade i 23 par tegelhögar - varje hög är en av dina parade homologa kromosomer, mer eller mindre. Till skillnad från Lego-tegelstenar, är vår röda Lego-sond som en stark magnet och finner sin match utan att behöva sortera genom pålarna.
"F" avser fluorescens. Vår röda sond kan gå vilse i högar med tegelstenar, så det är märkt med färgat fluorescerande färg så att det kommer att glöda. När den finner sin match bland de 23 parade staplarna, visar en fluorescerande tag sin plats. Så kan du nu se hur forskare och kliniker kan använda FISH för att hjälpa till att identifiera var (vilken hög eller vilken kromosom) en viss gen ligger för en given individ.
"I" och "S" står för in situ. Det här hänvisar till det faktum att vår röda Lego-tegelsten söker sin match inom provet du gav.
FISH och specifika blodkräftare
FISH och andra in situ hybridiseringsprocedurer används för att diagnostisera en mängd kromosomala abnormiteter - förändringar i det genetiska materialet, förändringar i kromosomer, inklusive följande:Radering - En del av en kromosom är borta
translokation - En del av en kromosom avbryts och sitter fast på en annan kromosom
Inversion - En del av en kromosom avbryts och återinsätts igen, men i omvänd ordning
Duplicering - En del av en kromosom är närvarande i alltför många kopior i cellen
Varje typ av cancer kan ha sin egen uppsättning kromosomala förändringar och relevanta prober. FISH hjälper inte bara till att identifiera de ursprungliga genetiska förändringarna i en sjukdomsprocess som cancer, men det kan också användas för att övervaka respons på terapi och sjukdomsavgift.
De genetiska förändringar som upptäckts av FISH erbjuder ibland ytterligare information om hur en individs cancer kan uppträda, baserat på vad som tidigare har observerats hos personer med samma typ av cancer och liknande genetiska förändringar. Ibland används FISH efter diagnosen redan har gjorts för att få ytterligare information som kan bidra till att förutsäga patientens resultat eller bästa behandling.
FISH kan identifiera kromosomala abnormiteter i leukemi, inklusive kronisk lymfocytisk leukemi (CLL). För kronisk lymfocytisk leukemi / lymfocytiskt lymfom tillåter FISH patienter att ta reda på sin prognostiska kategori: bra, mellanliggande eller fattiga. I akut lymfoblastisk leukemi (ALL) kan de leukemiska cellernas genetik berätta om risknivån för cancer och hjälpa till att vägleda terapeutiska beslut.
FISH-paneler är också tillgängliga för lymfom, multipelt myelom, plasmacellproliferativa störningar och myelodysplastiskt syndrom. I fallet med mantelcelllymfom är exempelvis en a transloka att FISH kan detektera kallad GH / CCND1 t (11; 14) som ofta är associerad med detta lymfom.