Genetiska stammar av HIV-1 och HIV-2

En av de primära hindren för att behandla eller utveckla effektivt vaccin mot HIV är den höga genetiska mångfalden hos själva viruset. Även om virus som använder dubbelsträngs DNA för att replikera är relativt stabila, går retrovirus som HIV tillbaka i sin replikationscykel (med användning av enkelstam RNA) och är mycket mindre stabila. Som ett resultat är HIV mycket utsatt för mutationsmutering, i själva verket omkring en miljon gånger oftare än celler som använder DNA.
Eftersom virusets genetiska mångfald utökas och olika virala deltyper överförs från person till person, kan det blandade genetiska materialet skapa nya HIV-hybrider. Medan de flesta av dessa hybrider dör, visar de få överlevande ofta större resistens mot hiv-terapi och i vissa fall snabbare sjukdomsprogression.
Hiv-variabiliteten skapar därför något av ett "rörligt mål" för forskare, med nya rekombinanta (kombinerade genetiska) stammar som kan motstå eller helt undvika neutraliserande medel. Några, som A3 / 02-stammen identifierad av svenska forskare 2013, kan avlägsna en persons immunförsvar mycket mer aggressivt än tidigare kända stammar.
Vad är HIV-1 och HIV-2?
Det finns två typer av HIV: HIV-1 och HIV-2. HIV-1 anses vara den övervägande typen, som representerar de allra flesta infektionerna över hela världen, medan HIV-2 är betydligt mindre vanligt och koncentreras främst i västra och centrala afrikanska regioner. Medan båda dessa hivtyper kan leda till aids är HIV-2 mycket svårare att överföra och mycket mindre virulent än HIV-1.
Inom varje av dessa HIV-typer finns ett antal grupper, subtyp ("clades") och sub-subtyper. Utan tvekan kommer andra subtyper och rekombinanta stammar att upptäckas, eftersom den globala spridningen av HIV fortsätter.
HIV-1 grupper och subtyper
HIV-1 är indelad i fyra grupper: Grupp M (betyder "major"); Grupp O (betyder "outlier" eller bortom där andra grupper ses); och grupp N (som betyder "icke-M" och "icke-O"); och grupp P (betyder "väntar"). De fyra olika grupperna klassificeras av de fyra olika simian immunbristvirusen (SIV) som var kända för att gå från apor eller schimpanser till människan.
HIV-1-grupp M
HIV-1 Group M var den första gruppen som identifieras och representerar idag cirka 90% av hiv-fallen över hela världen och kan hittas nästan i alla delar av världen. Inom denna grupp finns 10 undertyper, som kan stratifieras bland annat av deras geografiska fördelning och deras inverkan på olika riskgrupper.

Subtyp A: ses i Västafrika och påverkar främst heterosexuella och injektionsmissbrukare (IDU).
Subtyp B: Den dominerande subtypen i Europa, Amerika, Japan, Thailand och Australien, som representerar nästan all infektion i Nordamerika och cirka 80% av alla i Europa. Infektioner förekommer hos fler bland män som har sex med män (MSM) och IDU än heterosexuella.
Subtyp C: beskrivs som den vanligaste HIV-subtypen som representerar 48% av alla infektioner världen över, främst heteroseksuella och främst i Afrika söder om Sahara, Indien och delar av Kina.
Subtyp D: Isolera huvudsakligen i Öst- och Centralafrika.
Subtyp E: en subtyp som endast ses i en rekombinant form med subtyp A.
Subtyp F: bland en mindre andel infektioner som ses i Centralafrika, Sydamerika och Europa.
Subtyp G: bland en mindre andel infektioner som ses i delar av Afrika och Europa.
Subtyp H: bland en mindre andel infektioner som ses i Centralafrika.
Subtyp J: observeras i Nord-, Central- och Västafrika och Karibien

Subtyp K: begränsad till Demokratiska republiken Kongo (DRC) och Kamerun.

HIV-1-grupp O
HIV-1-grupp O upptäcktes 1990 och representerar endast 1% av infektionerna över hela världen. Denna HIV-grupp är isolerad i Kamerun och angränsande afrikanska länder.
HIV-1-grupp N
HIV-1-grupp N upptäcktes 1998 och har återigen bara sett i Kamerun med mindre än 20 fall dokumenterade hittills.
HIV-1-grupp P
HIV-1-grupp P är sällsynt typ av hiv, som först identifierades hos en kvinna från Kamerun 2009. Det kan skilja sig från andra hiv-grupper, eftersom dess ursprung har kopplats till en form av SIV som finns i västra gorillor. Även om klassificeringen "P" var avsedd att utgå från en "väntande" status (dvs. väntar på bekräftelse av ytterligare infektion) identifierades ett andra dokumenterat fall 2011 i en kamerunsk man.
HIV-2-grupper
Även om fall av HIV-2 har identifierats någon annanstans, är infektioner nästan uteslutande sett i Afrika. Det finns för närvarande åtta hiv-2-grupper, även om endast subtyperna A och B är de enda som betraktas som epidemier. HIV-2 antas ha korsade arter från en typ av SIV som påverkar sooty mangabeys apa direkt till människor.
HIV-2-grupp A ses huvudsakligen i Västafrika, även om internationella resor har lett till en liten handfull dokumenterade fall i USA, Europa, Brasilien och Indien. Däremot har HIV-2 Grupp B begränsats till delar av Västafrika.